，大部分河段為中俄界河。額爾古納河全長970公里，以海拉爾河為上源（或稱東源），全長1666公里。另說1，620公里（1，007哩，其中海拉爾河622公里）。主要支流（或稱西源）有克魯倫河。總流域面積15萬平方公里。額爾古納河右岸為山嶺森林，又是一代天驕成吉思汗的故鄉。
石勒喀河，黑龍江的北源。由音果達河同鄂嫩河匯成。流經俄羅斯赤塔州東南部，與額爾古納河匯合後稱黑龍江。長560公里。流域面積20.6萬平方公里。河口處年平均流量550立方米/秒，年徑流量14立方公里。形成中俄界河黑龍江。7—8月為汛期，常有洪水。斯列堅斯克以下通航。10月末—11月初至4月末—5月上旬結冰，封凍期約半年。在中國舊籍記載中，以石勒喀河為黑龍江上源。
幹流段
黑龍江干流（自漠河縣西北部的洛古河村石勒喀河河口起）全長2821公里。從黑龍江南北源匯合點起，到俄羅斯哈巴羅夫斯克（伯力）的黑龍江與烏蘇里江匯合點止，為中、俄界江。以下全部在俄羅斯境內。
額爾古納河與石勒喀河，於黑龍江省漠河縣西北部的洛古河村附近匯合後蜿蜒東流，始稱黑龍江干流，經黑龍江省漠河、塔河、呼瑪、黑河、孫吳、遜克、嘉蔭、蘿北、綏濱、同江、撫遠等縣（市），（對岸俄羅斯的行政區依次是：外貝加爾邊疆區、阿穆爾州、猶太自治州、哈巴羅夫斯克邊疆區）至哈巴羅夫斯克（伯力）與南來的支流烏蘇里江匯合後流入俄羅斯境內。在黑龍江省境內1887公里。黑龍江流域總面積約180多萬平方公里。[7]
在俄羅斯境內，自哈巴羅夫斯克（伯力）起，黑龍江下游全部在俄羅斯哈巴羅夫斯克邊疆區境內。依次流經哈巴羅夫斯克（伯力）、特羅伊齊克，阿穆爾斯克，阿穆爾畔共青城，烏利奇地區，尼古拉耶夫斯克（廟街），在尼古拉耶夫斯克（廟街）附近注入鄂霍次克海的韃靼海峽，將西伯利亞與庫葉島分開；為北亞最長的河流。[1]俄羅斯境內，有烏米爾河、阿紐伊河等支流匯入。俄羅斯境內長1400多公里。
河道特徵
黑龍江干流始於石勒喀河與額爾古納河匯流處，距河口2，824公里（1，755哩）。石勒喀河發源於內陸547公里（340哩）餘以遠西伯利亞音果達（ingoda）河與蒙古鄂嫩河的匯合處。額爾古納河發源於中國內蒙古自治區，距其與石勒喀河匯流處約1，609公里（1，000哩）。該水系流域面積約1，855，000平方公里（716，200平方哩），包括許多河流與湖泊。主要支流有西伯利亞的結雅（zeya）河、佈列亞河和阿姆貢（amgun）河與中國的松花江以及中國東部和西伯利亞之間邊界河流烏蘇里江。
習慣上將黑龍江分成上、中、下游3段。從黑龍江南北源匯合點起，到俄羅斯哈巴羅夫斯克（伯力）的黑龍江與烏蘇里江匯合點止，為中、俄界江。自洛古河村至黑河市為上游，長900千米；黑河市至烏蘇里江口為中游，長950千米；烏蘇里江口以下為下游，長970千米。
其上游流經茂密的落葉松林覆蓋的大興安嶺餘脈與阿馬札爾嶺松樹遮蔽的山坡之間的山谷。在西伯利亞阿爾巴濟諾附近，山嶺分開，河流進入開闊的高原地區。中游流入結雅河-佈列亞河盆地。河谷左坡與平原融為一體，令人難以覺察，而右坡與小興安嶺毗連。它進而沿著一條峽谷似的狹窄通道穿越小興安嶺，深度和速度遽增。其下游在低矮的、河水漫溢的兩岸間奔流，進入一片浩茫的沼澤，水道將地面切割開來，上面點綴著湖泊和水塘；河床多分支，水道變得很寬。
在西伯利亞列寧斯科耶附近，黑龍江最大的支流松花江將其黃色的、充滿泥沙的流水瀉入，在哈巴羅夫斯克附近，烏蘇里江與之合流。河床成了一個支流、港汊、舊河床、島嶼、沙洲和岬角的迷宮。在哈巴羅夫斯克，黑龍江距日本海海岸僅370公里，但其在被錫霍特山脈改變流向後，北流966公里才注入海中。[5][1]
主要島嶼
黑龍江干流上有許多衝積而成的島嶼，中俄交界段主要有：古城島、鷗浦老街基島、吳八老島、尹家大島、河東套子島、中地營子島、大黑通島、大黑河島、黃河口島、下馬場大通島、二道卡島、嘎牛戶西套子島、嘎牛戶東套子島、霍爾莫津島、王阿木河島、幹岔子島、布拉罕島、分水島、大江通島、施家亮子島、哈魚島、焦家亮子島、董喀叭亮子島、雪那洪島、青黃魚通島、八岔島、大夾信子島、撫遠三角洲。