，或交軍機處會同關係衙門議奏。特交的，由軍機處查議其可否，密擬辦法上奏；會同議奏的，或由軍機處主稿，或由所會衙門主稿，臨時酌定。
三、某些重大案件，皇帝特交軍機大臣審理擬定，或由軍機大臣會同三法司審擬。軍機大臣可在軍機處提訊，也可使用刑訊。應刑訊時，選用內務府公所或於步軍統領衙門進行。凡秋審案件，軍機大臣也參與。
四、重要文武官員之任免及各部尚書、侍郎、各省總督、巡撫、以至道、府、學政、關差、鹽政以及駐防將軍、都統、駐各邊疆地區之領隊大臣、辦事大臣等官員的補放，均由軍機大臣負責開列應補人員名單，交皇帝選擇任用。遇科考，也由軍機大臣開列主考、總裁名單，奏請皇帝選用。複試或殿試，軍機大臣負責核對試卷、檢查筆跡或任命閱卷官。
五、考查行軍之山川、道里與兵馬錢糧：凡有行軍，軍機處根據有關圖書，考查山川險要，道里遠近，如系邊遠地區，圖書中沒有記載地，要考查新舊檔案並加諮訪。應用地兵馬、錢糧，則由戶部、兵部、理藩院等衙門取簡明確數備查。遇有皇帝查訊的問題，即時呈遞。
六、軍機大臣可奉皇帝旨意，以“欽差”身分，往各地檢查或處理一些政事。
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