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趁著第一階段完美勝利的春風，由中華革命黨和國民黨人領導組建的護法武裝在各省也相繼揭竿而起，紛紛宣佈與西南各省一致行動，其實就是掛個名，誰不想佔據更大的地盤哪，藉著這個名義擴充實力。
其中規模比較大的有湖北襄鄖鎮守使、鄂軍第九師師長黎天才等人組織的“湖北靖國軍”，在襄陽宣佈“自主”，暫時割據“鄂東；前陝西警備軍統領郭堅不甘寂寞，組織“陝西護法軍”，也就趁著北洋軍沒反應過來，佔據了那點地盤，在鳳翔宣佈“獨立”。
此外，在山東、河南、浙江、江蘇、安徽、福建、甘肅，乃至東北等省烽火遍地，‘有心人’都先後組織了“護法軍”、“靖國軍”佔據了一兩個城池就宣佈“獨立”或“自主”，護法戰爭的烽煙席捲了全國大部分地區，讓百姓民不聊生。