五艘速度較快的驅逐艦及十艘“鯨級兩棲攻擊艦”被他安排為五個批次進行巡邏航行。巡邏航線設定為：自勿里洞島至單馬錫（今新加坡）及加里曼丹島的昆甸城之間進行三角形航線進行巡邏航行。
這也是南洋叢集為中國海提供的第一道警戒線。
海軍陸戰隊的主力則駐於勿里洞島的基地之上，一來看守那些被抓獲的當地人修築港口及駐地，另外則防備英艦對島上的攻擊。他們配置的“鯨級兩棲攻擊及”則分批來往於巴達維亞及勿里洞島之間，進行物資運輸。
勿里洞島長寬之比大約為7：5，整個島上的面積不過4，850平方公里，基地即位於島的中心地帶。此島西側三十多海里的地方以是邦加島，分別距巽他海峽及馬六甲海峽均為170餘海里左右，可以用作將來封鎖馬六甲海峽及巽他海峽的基地。
黃克輝在這裡佈置了三個海軍陸戰團及全部後勤單位，並且由鯨級兩棲攻擊艦進行海面之上的佈防。另外派出兩個偵察排分別在馬六甲海峽的出口及巽他海峽出口處的小島之上，隱密建立觀察哨，基本上杜絕了敵軍可以無怕來襲的可能性。
同時派出一個海軍陸戰團的部隊，搭乘五艘“鯨級兩棲攻擊艦”及醫療船組成的清剿艦隊，開始清剿附近海域的海盜，當然在看過那些訊問筆錄之後，本身以不大喜歡本地人的神州軍士兵，行起事來根本以無所顧忌。
首先這支清剿艦隊的航向東南，幾乎是陪伴著“明月號”一行，當然這支艦隊也負擔著在南洋叢集當中所轄範圍之內，尋找慕容楚楚的任務。
可就在這支清剿艦隊出航之後，僅僅三天之後的那一天，南洋叢集的艦隊就與英軍到達這裡的艦隊進行了對決。
對於香料群島，英國的東印度公司是一直企圖染指的，他們曾在巴達維亞附近設立商館。但是很快由於荷蘭人的破壞以及當地的惡劣環境，而死去英國人三百餘人。最後英國東印度公司不得不放棄與荷蘭王國的東印度公司，對於群島之中的香料進行爭奪。
而在雙方爭奪的過程之中，荷蘭人做了一件相當殘忍的事情。他們將班達島之上的本地人1。5萬餘人殺了個乾乾個淨淨，並將附近島上出產的香料大部剷除，僅只餘班達島上一處，以利於控制。
而此刻，由於嶽效飛的建議，荷蘭的巡洋艦都已經開始部分拆除大炮，並將這些大炮安置在巴達維亞城附近的小山之上。
至於這些巡洋艦，他們將要改裝成快速商船，航向印度方面，按照嶽效飛留給他們的清單，進行採購。
所以總的來說，這一批巡洋艦已經基本失去了作戰能力。
此刻，巴達維亞的防守力量，除了黃克輝率領的十五艘戰艦之外，僅餘下經過幾乎一個半月連夜趕工進行修理戰列艦隊，共計十艘戰列艦，另外就是巴達維亞城兩側矮山之上增加到兩百多門大炮的炮臺。
另外，以是作為巴達維亞城陸地防守主力的一個海軍陸戰團。為了對付英軍不知何時會到達的攻擊，巴達維亞城中迅速建立了街壘，作為迪曼手下的荷蘭方面的軍隊，則負責城內的防守任務。而神州軍由於裝備有腳踏車，具備在道路相當不錯的城內快速移動能力，因為擔任了圍殲及機動防禦的工作。
英國人由於垂誕於香料群島的金錢，向這裡投了下了下了重注。一隻由二十艘戰列艦及三十艘巡洋艦組成的編隊，掩護一支由十一艘運輸艦裝載的1。5萬名英國海軍陸戰隊來到了大巽他群島之上重要的海上通道一一巽他海峽。
這已經是傾英國全國所有的海軍力量的過半數左右，當然如果算上武裝商船的話，英國人的海軍數量可以達到將近三百艘之多，可是專門用來作戰的軍艦並不多。尤其是用來作為船隊中堅力量的巡洋艦的數字，以更少了。
當然，他們並不知道他們面對的將是什麼人。在所有英國人的以上當中，六十多艘戰艦的艦隊，如此龐大的力量使英國人深信他們一定獲得最終勝利。
而且英國艦隊為了不被荷蘭艦隊在路途之中攔截，他們並沒有走順風順水的馬六甲海峽。而是頂著這時印度洋上不時會颳起的強大海風，順著印度洋的夏季季風及洋流，自西門達臘島的西側到達巽他海峽的西南側，然後自巽他海峽透出，從海上直逼巴達維亞城。
因此，英國艦隊透過巽他海峽之時，根本毫不避諱的外加耀武揚威。根據他們的所知道的訊息，這兒僅只有荷蘭人的一個指示航線的燈塔，所以他們根本毫不在意。
這兒距巴達維亞城的距離大約有將近160公里之遙，