因為敵人的畏戰，張連生和張承武只是不斷的接受城池而已。不過，在接受地盤時，保安團可當地的團練武裝不斷髮生衝突。這些保家保族守衛祖田的練勇們作戰勇敢，比金礪部和魯王所部戰鬥慾望強多了，當保安團大軍逼近時，這些練勇大多往山中一躲，等保安團大軍分散後又鑽出來襲擊農會村委會等機構，這讓張連生和張承武煩不勝煩。而且浙中之地多山，會稽山、天姥山、天台山、大盆山、仙都山、雁蕩山等等。當然，這還是在浙江，若是到了福建，恐怕保安團的壓力將會更大，那裡幾乎就是山連著山。
好在團練之流都是疥癬之疾，只要農會建立起來勢必會壓縮團練的活動空間，到時不用正規部隊，僅僅只是農衛隊就能消滅團練了。對待團練，保安團還是有經驗的，畢竟當初保安團也是這樣起家的。
如今浙江諸府都已經建立起了各層機構，從府級政權到縣級政權，再到鄉級政權和村級政權，可謂是從上到下將新納入的地盤牢牢的掌控在手中。如此這代價也是巨大的，不提數量眾多的工作人員薪資花費，單單免去新根據地的頭年賦稅的這項政策就讓保安團的腰帶為之一緊。還有留駐部隊，剿滅當地團練，防禦浙南的金礪和魯王進攻，這些都將是鉅額的花費。
對於是否攻佔浙南的處州府和溫州府，仇天行一直有些猶豫。其實他很想將這兩府納入懷中，從而真正的佔據一省之地。可是隨著軍情處的情報傳來，南方各方勢力似乎正在密謀，據軍情處分析，目標很可能就是保安團。得知這一情報後，仇天行這才放棄了繼續攻打處州府和溫州府的念頭。其實仇天行也知道此次敵人只是不戰而退，實力大多保留了下來。若是真的真刀真槍的幹上了，敵人退無可退時肯定會拼命的。處州和溫州多山，這一打下來保安團損失不會太小。而且這次東征保安團收穫的果實已經足夠豐富了，想要將食物消化轉變成自己的肌肉也要花一段時間。最終，仇天行還是放棄了一統浙江這誘人的想法。
如今保安團總部過半兵力雲集浙江，這樣一來不僅僅西部空虛，就是對後勤補給也是很大的壓力。軍隊不打仗時都要分散四方，以當地生產供養軍隊生活。最後仇天行讓張承武率三營佈防浙江，而張連生帶其餘部隊返回駐地。最近佔據九江的吳三桂部似乎蠢蠢欲動，張連生帶領大軍回到安慶可以維繫西部的穩定。至於近衛營和七營的各個縱隊則各自迴歸編制。這些縱隊一路的行軍調動還有駐防後勤補給等問題都要軍政部來操心，如此一來軍政部倪戰又要好一陣的忙碌了。當然，這樣一來一方面軍和二方面軍這個臨時編制也要解散了，張承武和張連生這臨時的軍長也沒當多久就得卸任了。
除了這些外，戰後的嘉獎，傷殘人員復員後的新工作安排，陣亡將士的撫卹，有功將士級別的晉升，以及各營編制和人員的調動，等等等等，這些都是讓人頭疼的事情。
軍隊其實是一個很嬌嫩的東西，一旦一日不食，一旦有功不賞，一旦軍餉欠缺，它的戰鬥力都會下滑。而且戰後必須休整一段時間，否則軍人的情緒將會難以得到緩解。所以這才有了大炮一響黃金萬兩以及養兵千日用兵一時之說。
不過雖然總部在大戰中付出很多，但是收穫更多。浙江本就是中國富庶之地，若非戰事不斷，此地當是魚米之鄉人煙鼎盛之地。不過即使如此，人口也比西部苦寒之地多得多。拿下浙江大半後，如今總部治下民眾多達千萬，地域橫跨幾近兩千裡。另外，新納入統治的根據地將會提供更多的市場。那些建築隊、服裝鞋帽廠、車廠等有關衣食住行之類民生行業的企業將會得到發展壯大的機會。雖然浙江之役消耗了大量財富，但是這些財富並不是白白消耗了，它將沉澱在浙江大地，等待著來年浙江經濟的迅猛發展。
如此一來商務部的地位將會大漲，甚至仇天行有考慮將民政部下屬的工業司合併到商務部中，這樣一來商務部便成了工商部，工作起來會更方便一些。當然，若是這樣做的話，厲元寶的權勢將會大增，成為各部部長中僅次於周震的存在。
仇天行如今一手抓人事一手抓財政，處級幹部也就是軍隊中的中隊級別以上升遷調動必須得仇天行簽字才行。同樣，財政上千兩金額以上撥款也必須通報團辦知曉，在仇天行簽字同意後才能實施。一手權一手錢，再加上內務處的聞風而報，軍事學院和政法大學的校長職位，以及扶持厲元寶打壓膨脹過快的周家派系，挑動章壯成和劉進財不和，這些種種手段用盡，仇天行將團部牢牢的控制在自己手中。只是，這樣一來，仇天行每日的工作將是極其繁忙的。