量黃金、珠寶和藝術品。在新加坡，遷政信大佐用暴行開路，1942年2月21日開始，他下令對新加坡華人進行大屠殺，馬來半島共有4萬華人被屠殺。
接著他要求華人向天皇貢獻5000萬日元“贖罪費”處於驚恐中的新加坡華人無法在短期內籌集到如此數額巨大的款項，他就替華人向橫濱正金銀行貸款，用這筆巨大的財富，送給天皇作為禮物，然後強迫華人交出大量金磚和外國硬通貨以及有形資產。
日本軍隊和黑社會還建立了慰安婦制度，從亞洲各國，主要是朝鮮和中國徵發婦女充當慰安婦。據估計被迫害婦女多達20萬人。這些婦女用肉體換來的骯髒的錢也流入了日本軍國主義者手中，成為金百合計劃的一部分。
中國的國寶，人類學歷史上最珍貴的北京猿人頭蓋骨和牙齒可能被日本侵略軍劫掠到了日本皇宮。
1941年11月，離太平洋戰爭爆發還有幾個星期，北京協和醫學院的工作人員擔心日本會把這個稀世珍寶搶走，打算將化石轉移到美國史密斯學會，等抗戰勝利後再運回來。他們將化石細心地包裝好之後，放在了9個鐵製的彈藥箱裡，這些箱子交給了美國海軍中尉福利。
福利當時享有外交豁免權，這些箱子可以當作他的私人財產帶走。但福利還未離開中國，珍珠港事件就爆發了。為保護化石，他隨身攜帶箱子，四個半星期之後，一位日本軍官搶奪他的箱子。福利作為戰俘勞工在三菱公司的礦井中工作了三年半，戰後他向朋友們講述了這件事情。
透過金百合計劃，日本在東南亞各國掠奪的財富都經馬尼拉運到東京。而股票、證券、持金證書等非物質財富被送到橫濱正金銀行和日本銀行，然後再轉移到日本人在中立國銀行開設的帳戶上。日本將掠奪的金澆鑄為符合國際標準的金塊，再存入中立國銀行。
當時橫濱正金銀行最大持股人就是裕仁天皇，他擁有22％的股票。戰爭結束時，裕仁已擁有資產1億美元，這相當於今天的10億美元，這筆鉅額資產以黃金和外國貨幣的形式存在瑞士、南美、葡萄牙、西班牙和凡蒂岡的銀行裡。
在南京成為廢墟時，中國珍貴藏書、檔案等還被日軍嚴密保護。後來曾有1000多名日本專家來到南京，為日本皇家圖書館優先挑選最珍貴的物品，天皇曾親自過目最珍貴物品的目錄。
選中的物品都被編號和打包，用300多輛卡車把這些箱子運往上海，然後裝船。這些書的一部分被用來建立位於東京的東亞研究所、東方文化研究所、東亞經濟研究所、東亞地方病研究所、大東亞圖書館等。
戰後美國經過調查後確認，日本至少有17處地方存放這些戰時搶來的書籍，其中有日本皇宮、皇室內宮、靖國神社、東京科學博物館、東京美術學院、早稻田大學、東京帝國大學和慶應大學。美國佔領當局的結論是，日本有300萬冊從中國各地圖書館搶來的珍貴圖書和手稿。日本僅歸還了大約16萬冊，不足6％。