西老兄弟的捨命衝殺，太平的另一名重將秦日綱還是僥倖衝過了馮三保的親自率軍阻擊，滿身血汙的衝過了吳軍阻擊陣地。然而秦日綱卻很快就發現噩夢還遠遠沒有結束，正在源源不竭從其他戰場趕來的吳軍將士，已經在孝陵衛以北編織起了一張天羅地網，張弓設套等他去鑽，秦日綱手裡最後的幾百人幾乎沒有任何可能衝得過孝陵衛，迫於無奈之下，秦日綱也只好是帶著殘兵敗將逃向北面的紫金山山區，妄圖利用山區的複雜地形掩護，擺脫吳軍的追擊阻殺。
很可惜，吳軍騎兵重點防範的就是太平軍大股敗兵，還沒等秦日綱帶著幾百敗兵衝到明孝陵附近，吳軍騎兵就已經追上了他，混戰中一顆流彈正好擊中秦日綱的後頸，當場結果了他的性命，餘下的太平軍敗兵雖然也有不少人成功逃進了山林之中，卻再也沒有一個人能有秦日綱的威望和號召力能夠服眾，導致敗兵在山林中迅速星散，再也無法翻起任何的風浪。
導致太平軍突圍計劃徹底失敗的另外幾個罪魁禍首吉慶元和方海宗等人一直被困在南京城中，幾次率軍試圖從其他的城門突圍，都被守在城外的吳軍擊退，身邊的軍隊也飛快的越來越少，最後方海宗被部下捆綁獻給了吳軍，袁得厚主動放下武器投降，陳得才和李容發倒是仍然還在帶著軍隊和吳軍打巷戰，還有許多沒能逃出城外的太平軍頑固分子也加入了他們，但是已經沒有了堅固的工事可守，彈藥武器也沒有了保證，太平軍在巷戰中的表現也就沒了前幾天那麼神勇出色，被吳軍徹底消滅就只是一個時間問題。
其中最值得一提的還是吉慶元，仔細分析了混戰局勢之後，吉慶元居然帶著兵掉頭向北，想從吳軍之前炸出的神策門缺口處突圍，結果守衛神策門的吳軍胡懷昭所部還真被吉慶元殺了一個措手不及，又因為此前在神策門大戰中實力消耗過度，被吉慶元殺得死傷消耗不***得吳超越只能是親自率領中軍營隊上陣，費了不少的力氣才擋住吉慶元的瘋狂反撲，把吉慶元軍重新趕回了南京城中。
在此期間，洪大教主如果能夠做出決斷，讓蒙時雍率領的南京太平軍保護自己發起突圍的話，那麼憑藉蒙時雍軍的體力優勢和精良裝備，殺出一條血路衝出南京其實把握很大，擺脫吳軍追殺逃離南京戰場也不能說是毫無希望。但還是很可惜，已經習慣了奢華生活的洪秀全已經說什麼都不想再去吃二茬苦受二茬罪了，呆在前明宮城裡說什麼都不肯挪窩，替洪秀全掌軍的蒙時雍既沒有膽量魄力強行挾持洪秀全突圍，也沒有經驗和目光能夠看得到這個天賜良機，只是傻乎乎的帶著近萬南京太平軍堅守宮城，眼睜睜的看著吳軍殲滅城外太平軍，還有徹底包圍洪秀全藏身的宮城。
最後，還是在到了李秀成等人被俘的當天夜裡，洪秀全才召來了蒙時雍和一些隨駕文武，命令蒙時雍保護自己的另外三個兒子連夜突圍，逃出南京另謀生計，然後洪秀全又頒佈了自己生命中的最後一道聖旨，全文曰：
“大眾安心，朕即上天堂，向天父天兄領到天兵，復下凡來誅殺妖兵，先誅超越小妖，再滅清妖朝廷，重興天國，一統江山萬萬年。欽此。”
宣佈了自己的最後旨意之後，洪秀全先是命令衛士強行趕走了號哭磕頭不止的蒙時雍等人，然後親手拿了一支火把坐到了自己的八十幾個年輕貌美的王娘中，還有堆滿前明金鑾殿的奇珍異寶之中，笑著對哭哭啼啼的眾王娘說道：“哭什麼？朕帶你們去天堂享福，有什麼可哭的？得笑，都給朕笑起來。”
言罷，洪秀全將手中火把奮力投向了堆滿金鑾殿四周的柴草上，淋過火油又灑過火藥的柴草馬上就燃燒起火，迅速蔓延，也很快就把金鑾殿包圍在了一片熊熊烈火之中，濃煙火海中，還又響起了洪秀全從容不迫的大喝聲音，“不許哭，都給朕笑！朕要帶著你們去見天父天兄了，不能讓朕在天父皇上帝面前丟臉，在天兄耶穌面前失了顏面！”
軍事能力給楊秀清、李秀成和石達開等人提鞋都不配的洪大教主人死禍遺，徹底坑苦了蒙時雍所率領的近萬南京太平軍，還有他託付給蒙時雍的三個兒子——看到宮城裡突然起火，率領吳軍將士包圍宮城的戰場老麻雀曹炎忠用腳指頭分析，也知道宮城裡的太平軍準備棄城突圍了！所以曹炎忠除了馬上做好迎戰準備外，又在第一時間派人聯絡城外諸軍，讓各路友軍也做好攔截準備，早早就佈下了天羅地網等太平軍來鑽。
與曹炎忠截然相反，從來就沒有上過一次戰場的蒙時雍卻是浪費寶貴時間，先是在金鑾殿外哭祭了許久的洪秀全，然後才下令軍隊準備突圍，還選擇了在註定要被吳軍重點封鎖的東安門突圍