類修煉魔法的速度和創造力的她不過十四歲已經是一位強大的魔導士了，在這座魔法學園都市的學員排行榜上是前三名的強者，而前五名的強者清一sè都是半jīng靈。
但是半jīng靈是很稀有的。人類和jīng靈之間的愛情雖然很多，但因為人類和jīng靈之間巨大的壽命差距使狠多相愛的人類和jīng靈望而卻步，可是依然有很多的jīng靈想不為天長地久，只為曾經擁有的放棄一切的去愛。
jīng靈族人為了這些不顧一切的jīng靈傷透了腦筋，因為每一位jīng靈都會因自己的伴侶死去而心碎跟著離去，如果是壽命相當的種族好還，但如果是人類，十倍的壽命差距等於是在謀殺jīng靈。所以他們不斷的遏制所有和短命種族的相愛的jīng靈。
可惜jīng靈是個zì ；yóu的種族，如果真的愛上了短命種族的人其他jīng靈是不會阻止的。御坂美琴的爸爸就是一位jīng靈，他不顧一切的愛上了她的媽媽一位人類的少女。他們在魔法學園都市相識，在地底冒險相知，在數次生死的冒險之旅中相愛，回到魔法學園都市後正式結為夫婦。他們幸福的度過了三年時光，然後美琴的媽媽懷孕了。
當美琴出生的時候悲劇發生了，她的母親難產了。由於實在魔法學園都市這裡只有信仰元素的魔法師。沒有信仰聖光或光明神的聖騎士和牧師。在這普通的醫療環境下，難產根本沒法救活。雖然美琴安全的出生了。但是她母親卻大出血而死。
看見自己的愛人死在自己面前的美琴爸爸，抑制不住悲傷心碎而死了。可憐的美琴從小就沒有了父母，被這個城市裡最強大的同時也是最有善心的魔導師之一的亞雷斯塔。克勞利所收養。
在美琴眼裡，亞雷斯塔本是一位很有愛心的魔導師。十歲前他們一起生活的非常幸福，雖然父母雙亡但是在這位慈祥的魔導師撫養教育下美琴有個幸福的童年。
直到十歲生rì那天美琴的噩夢降臨了。為她準備生rì禮物的亞雷斯塔去城市裡的拍賣行為她買下一個塊非常瑰麗的紅寶石，回到家裡拿出紅寶石的亞雷斯塔準備藏起來給美琴一個驚喜，這時他突然xìng情大變，他沒有將寶石送給美琴，反而在他生rì的這天將她抽了她一大罐血液，並將因此昏迷的她送到了魔法學園，自己開始各種禁忌的魔法實驗。
他的目的好像就是要造出一具，完美的魔法師的身體。他用禁忌的魔法鍊金術將美琴的血液製造了和美琴一模一樣的人造人。並開始解剖她們妄想在她們身體中找出半jīng靈完美魔法天賦的原因，但始終一無所獲。於是他開始先從人體開始解剖，但是人口的失蹤一定無法隱瞞。為了不被人發現，他選擇了召喚異界有魔法天賦的人類來研究。
從昏迷中醒來的美琴本以為自己因老是不好好修煉魔法而被她的養父討厭了，而被弄暈丟棄到了魔法學園。為了回到自己的養父身邊她拼命的學習魔法，以她的天賦在三年的不斷努力突破下，從一個普通如眾人的電系中級魔法師，變成了現在強大的電系魔導士。
美琴覺得自己已經做到了養父的期望，就回到了三年沒有回到的家中。但是卻發現家中沒人，她去實驗室看看也沒發現她的養父，但卻在實驗室裡發現幾具被解剖的屍體，這些屍體和她長的一模一樣。
於是她瘋狂的將整個房子用魔法摧毀了。她知道自己養父出來在家裡實驗，在城市的另一個角落也有一個實驗室。然後準備飛向了另一個實驗室。但這時卻被他養父的學徒鈴科百合攔住了。
這位學徒也是一名半jīng靈，但她不幸的是她是被她的導師從山賊窩裡找出來的。原來她的jīng靈母親在懷著她和他人類父親來魔法學園都市的時候被一群山賊給搶了，他的父親被活活砍死。母親則被山賊搶去，因為懷著孕沒有被侮辱，但她母親知道等她生下孩子就是不幸的開始。於是她在生下百合後就自殺了。這群山賊發現jīng靈美女死了，於是憤怒的想從山崖邊將嬰兒拋下殺死，還好被路過的亞雷斯塔發現，亞雷斯塔救下了百合並將所有山賊殺死。亞雷斯塔在裹著百合的布上發現了她的jīng靈名字鈴科百合。
他把百合帶回了學園都市，但是作為一個魔導師他一直醉心研究魔法，養育一個美琴就耗費了他所有的空餘時間，實在沒時間再撫養一個孩子，所以他開了一個孤兒院專門收養孤兒，由於百合是一位半jīng靈有著良好的魔法天賦，於是亞雷斯塔就收她做了徒弟，從小就很關心她，而百合對這個關心愛護自己的導師