可是做皇帝最鍾情的方術了，所以早在周靜帝時期就誠邀他出任國子博士，可是孫思邈只醉心醫學和修道，對仕途毫無興趣，稱病不就。隋朝兩位皇帝和唐朝唐太宗都想找他去當官，討教長生之道，孫思邈索性躲到四川峨眉山一帶修煉行醫去了。
孫思邈以前曾說過，如果將來出了賢明君主，他可以出來做些濟世活人的事，唐太宗李世民登基之後，聽說了這件事，自詡還算明君，便下旨誠邀孫思邈進京。孫思邈欣然前往，那以後便住在京城了，李世民經常跟他討教養生之道，獲益匪淺，要封他做官，還要給他爵位，都被孫思邈謝絕了。唐太宗對他更是敬重，賞賜了他不少銀錢，這些他卻沒有拒絕，只不過，差不多都用來跟別人買方劑了。
孫思邈特別喜歡收集各種民間驗方秘方，以及各種新藥，為此蕩盡家產也不可惜。這些方劑後來全部記錄在他的著作《千金要方》和《千金翼方》，兩本書的記載的藥方加起來有近萬個之多大部分都是他蒐集整理的民間驗方秘方。
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他之所以把這兩部書都以“千金”命名，正史上說是因為他認為這些方劑是用於救治人命的，而人命貴過千金，故以“千金”命名，其實，是因為這兩部書的很多醫方，都是他不惜重金買來的，所以這些方劑真的是價值千金，才以此為名。
當然，孫思邈自己家產並不算多，購買大量方劑的巨資不是他個人家財能支撐的，前期主要靠自己的家產，後來，他深得唐太宗李世民的敬重之後，李世民經常賞賜他大量金銀，這才使他有花巨資收購民間經驗方和秘方的能力。
孫思邈親自給彭炳治療哮喘，因為附片有毒，而又不會正確的炮製方法，所以沒辦法提高用量，療效也就很不令人滿意