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為了更好地完成自己的使命，“阿爾法”部隊提出了新的目標，這就是“在任何一個可能出現恐怖主義的環境中，‘阿爾法’部隊都要有‘自己的人’”。隨即，“阿爾法”部隊開始擴大規模，成員數量大增。預防性措施並非白費工夫，經過５年訓練，“阿爾法”部隊終於真正成為了蘇聯的第一支反恐怖“拳頭”。在近３０年的成長曆程中，“阿爾法”部隊參與了數十次反恐行動，屢屢大顯身手，立下了顯赫戰功，成為世人矚目的一支反恐怖利劍。
自成立伊始至２０世紀８０年代初，“阿爾法”一直戰鬥在打擊恐怖暴力活動的戰場。近年來，中亞地區及俄羅斯境內恐怖活動十分猖獗，僅近三四年來俄羅斯就爆發了十幾起嚴重的劫機、暗殺、爆炸、綁架等極端恐怖活動，“阿爾法”別動隊對於變動中的俄羅斯社會局勢穩定，發揮了重要作用。
在“阿爾法”的歷史上也有沉重的年代。“阿爾法”部隊被企圖拉進政治和民族運動之中，用於對付自己的反對派。１９９１年，“阿爾法”部隊被劃入俄羅斯總統衛隊序列，任務仍是繁重的，責任仍是巨大的，但已不再是原先的那支部隊了。在布瓊諾夫斯克和五一城，“阿爾法”部隊計程車兵被用作普通的步兵參加作戰行動，於是遭受到了巨大損失，經受了血與火的考驗。
“阿爾法”部隊哈巴羅夫斯克分部副主任尤里·布里吉金上校講述了哈巴羅夫斯克分部的許多事情。原來，根據自願原則，該部隊的軍官只進行過一次退役，即１９９２年。當時出現的社會問題是：“阿爾法”部隊要麼解散，要麼劃歸內務部，人們對此難以接受。這裡有數代“阿爾法”戰士，有在部隊中服役三年的年輕人，也有從１９８５年便參加部隊的老兵。雖然工資太低而且還時常無法及時領到，但這都不是他們離開部隊的原因，他們離開的惟一原因是身體的狀況。
２０世紀９０年代初，“阿爾法”捲入社會上層的###，使這支精銳部隊的良好聲譽遭受重創。１９９１年１月，前蘇聯政府派遣“阿爾法”部隊前往立陶宛加盟共和國首都維爾紐斯佔領電視發射塔，阿爾法部隊未發一槍便順利完成了任務，但卻犧牲了一名戰鬥成員。當刨根究底的記者們力圖弄清死者的身份時，以戈爾巴喬夫和當時的克格勃主席克留奇科夫為首的莫斯科官方卻極力否認有傷亡者，但神秘的光環還是無可避免地消失了，報界終於弄清了這支特種部隊就是傳說已久的“阿爾法”部隊。此後，高層領導人曾經不止一次地試圖利用“阿爾法”部隊去完成一些與反恐毫無瓜葛的任務。
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“阿爾法”應時而生（3）
１９９１年８月，在前蘇聯局勢最為動盪的時候，“阿爾法”部隊曾接到當局指示，要求其進攻議會大廈“白宮”並逮捕葉利欽。但許多隊員認為此舉會造成濫殺無辜，傷人太多，因而抗旨不遵。後來，據一位當時的“阿爾法”部隊指揮官透露，如果政變領導人下定決心於１９日當天進攻議會大廈，應該說還是具備很大的成功機率的。但時不我待，過了這一天，就根本不可能成功了。事件結束後，“阿爾法”領導人被革職查辦，隊員停發兩個月薪金，全隊進行深入整頓。蘇聯解體以後，已是俄羅斯總統的葉利欽深知“阿爾法”的救命之恩，遂將頗受自己賞識的“阿爾法”從克格勃中召至麾下，隸屬於總統警衛局，專門負責總統安全保衛工作，直接受自己指揮。
然而僅過了兩年之後，“阿爾法”便失寵於葉利欽。到了１９９３年１０月，葉利欽與議會矛盾激化，以副總統魯茨科伊和議長哈斯布拉托夫為首的反對派聚集在議會大廈，與葉利欽分庭抗爭。葉利欽竟然下令“阿爾法”進攻“白宮”，“阿爾法”再次跌入政治旋渦。“阿爾法”再次“抗旨不遵”，拒絕執行葉利欽攻打號稱“白宮”的俄議會大廈的命令，而是儘自己所長與議會保衛者們展開了談判，為他們提供了個人安全保障，促使幾百名議員和普通公民主動撤出了議會，避免了事態惡化和進一步流血。此後，“阿爾法”由於拒絕執行總統命令而失寵於葉利欽。同年年底葉利欽簽發總統令，將“阿爾法”剔除總統警衛局，重新回到國家安全總局的旗下，擔負反恐怖任務，直至今日。
１９９１年“８·１９”事件後，隨著前蘇聯克格勃解散，克格勃所屬的職能部門相繼成為俄羅斯獨立的安全保衛機構。“阿爾法”特種部隊的歸屬問題也隨之發生過多次變化。最初，“阿爾法”特種部隊