忌謀反，只是因為他是國舅而不忍心處治。趕緊又奏：“薄昭，是反文帝的舅舅，文帝由代王做了皇帝，薄昭立有大功。後來昭犯罪，只是由於殺了人，文帝讓百官穿上素服，哭著殺了他。到今天下人無不讚頌漢文帝是明君。而長孫無忌不念兩朝對他的大恩，竟然謀奪社稷，他的罪惡怎麼能同薄昭同日而語呢。所幸其奸惡之狀自己暴露了出來，逆賊自然而然地服刑，陛下還疑慮什麼呢？還不早做決斷古人有句話：‘當斷不斷，反受其亂。’安危之機，間不容髮。長孫無忌是當今的奸雄，是王莽、司馬懿之類的壞人啊陛下少有一點耽擱，臣怕變亂馬上在陛下身邊發生，後悔可就來不及了啊”
李治聽了，覺得是這樣，竟然沒有親自審問長孫無忌，就下昭削去他太尉的官職、奪了他的封邑，留了個揚州都督的官銜，外放到黔州安置，允許給他一品官的實物供給。
長孫無忌被放逐，關隴頑固集團的支柱垮掉。在武則天的指揮下，又對他們進行了徹底掃蕩。還是由許敬宗出面上奏：“無忌謀逆，由褚遂良、柳姡А⒑�ス股榷�桑瑠＇仍潛通宮掖，謀行鴆毒，于志寧亦黨附無忌。”
從一步步登上後位到漸漸掌控朝政，就在這時李治病了。就是這正當威年的李治身上就發現了多種疾病，此時的李治在朝堂上坐久了根本受不了。有時被大臣們圍著爭吵不休時，會頭暈目眩，甚至一時看不見東西。皇帝身體不好，更讓武皇后想為之分憂，為之排難解紛，輔佐皇帝就成為她義不容辭的責任。
武皇后決定讓李治率領百官到東都洛陽住一段時間，目的也有讓他改變一下環境，讓身體好轉。因為長安宮的地勢低，潮氣太重，不利於李治的寒溼病，皇帝心緒不佳，換個環境也會好一點。
此時武皇后還不是皇帝，朝廷制度她還有能力去改革。但如今她是皇后，統領六宮，對後宮制度，她決定要改動改動。她認為後宮中皇帝的妻妾太多，前文提到有皇后、四妃、九嬪、九婕妤、四美人、五才人、另有三班各二十七御女為宮內八十一命婦。都是從眾宮家屬和天下選來的美女，後宮女人成堆，外戚成群，前朝因此出現的問題也太多。皇帝被美女包圍，，諸妻妾產生的事由也會不斷干撓皇帝的朝綱施政。
首先她決定把人數減少，四妃變為二妃、九嬪變成四人。其他的女官、官女要安排各自的實職工作，主要身份在於職司，根據後宮的職司進行調整，決定人數。不能就等著給皇帝娛悅，為皇帝生兒育女，首先想到自己是後宮的職司。其次，就是皇后以下的兩個妃子和四個嬪妾，也要想到如何幫助工作。因此，武皇后把皇妃改名為“襄德”、四嬪改為“勸義”，都有協理、幫助之意。她所以取此名稱一點也不奇怪，因為她就在全力襄理皇帝工作，她也要妃嬪共同協助。
顯慶五年正月，因對朝鮮半島用兵，李治率領百官離開東都洛陽，返回北方就近指揮，擬於山西幷州駐駕。洛陽到幷州計八百多里，正月甲子由洛陽出發北上，至二月辛已到達幷州。
幷州是當時的四大都督府之一，是唐初北部中國的重鎮。車駕達幷州後，設朝堂、內殿，統之曰“行在”，即朝廷的臨時宮殿。李治在此處理朝政、指揮對朝鮮半島的用兵。
幷州是武皇后的祖籍之地。貞觀九年，她父親病故於荊州都督府，武皇后隨母扶靈柩回幷州祖籍葬父，在這裡度過一年孤苦伶仃的悽慘時日。李治這次駐駕幷州，就是有意讓武皇后衣錦還鄉，向世人表示他對皇后的崇愛。
武皇后今非昔比，自然感到榮光。三月丙午日，她以皇后一國之母身份在幷州行宮的朝堂上宴請親戚故舊和鄰里，讓婦女領宴。按舊時規矩，應由皇帝接見群臣和百姓，皇后在內殿接代女賓。這次因李治體力不支，他也故意讓皇后顯示身份，則讓武皇后代表皇帝內外接見，全權處理。武皇后滿面春風，向宴會上的群臣和百姓致意，並以李治的名義宣詔：幷州婦女年八十以上，皆版授郡君。
郡君是四品到五品的官銜。這不僅是武皇后給故鄉百姓的榮典，也是她提高婦女社會地位的一項舉措。
接著，皇上、皇后又在幷州城西郊觀看大都督府操練軍隊，進行了閱兵。直至四月才從幷州返駕洛陽。
顯慶五年十月，李治的病情加重。這時，對朝鮮半島的戰事正處緊張階段，朝綱政事、戰爭軍務都要處理，重病的皇帝無法視朝。於是，“百司奏事，上或使皇后決之。後性明敏，涉獵文史，處理皆稱旨。由是始委以政事，權與人主侔矣。”
其實此時的李治因身體條件太差，已難親理朝政，就已把