擊
20世紀的日本新宿，是各路黑道組織盤踞之地。在一座名叫“極道天堂”的大廈內，安生組老大安生攜帶鉅額日元一夜之間神秘失蹤。安生失蹤，黑道中各色人士捏造著千奇百怪的離奇流言，這令安生忠實的愛將垣原極為惱怒，他視安生為自己的精神教父，決心一定要找到安生。
阿叔，這個一臉諂媚之色的小老頭向垣原透露情報，是曾與垣原有仇的鈴木綁架了安生。垣原私自把另一組織的鈴木關進刑室，嚴刑逼供。鈴木所在組織的頭目趕往刑室向垣原興師問罪，卻看到鈴木已經渾身是洞，面板幾乎被滾油燙穿，大家對垣原的兇殘戰慄不已，而假傳情報的阿叔早已聞風而逃。
垣原的莽撞招來了風波，黑幫長老讓垣原必須就鈴木一事謝罪。垣原拿出了一把長刀，他選擇的懲罰方式是讓自己永遠嘗不到甜味，於是當眾割掉了自己三分之一的舌頭，血腥的場面讓在場者幾乎昏厥。
斷舌的垣原接到安生情婦嘉倫的電話，她發現了阿叔的線索，他們透過一個販賣海洛因的女人找到了阿叔的同夥迦納，毒癮發作的迦納在垣原逼問之下供出安生已經被殺死，而那個冷血殺手的名字叫做阿一。垣原感到憤怒之極的絕望，他用鋼針刺透了迦納的頭顱，將他棄屍街頭，他發誓一定要找到阿一。
新宿街頭的一家餐館內，一個靦腆膽怯的服務生頻頻上錯飲料，經理對他破口大罵，他唯唯諾諾地不斷道歉，甚至痛哭流涕。垣原絕對不會想到，這個怯懦的男孩就是令黑道聞風喪膽的殺手阿一。
每當夜晚來臨，穿著黑色盔甲的阿一便開始了瘋狂殺戮，在瘋狂殺人過後，阿一總是體會到發洩的快感，卻又陷入了負罪與困惑之中。
垣原密切探訪著阿一的行蹤，在阿一殺死了垣原所有手下時，他們終於在“極道天堂”的頂樓狹路相逢。垣原壓抑不住極度的興奮，他渴望阿一可以殺死自己，用一種持久而殘忍的方式，他想深深體會那種瀕死的絕望。然而事情卻在瞬間急轉而下，阿一被一個為父親復仇的孩子殺死，而垣原在自殘之後也跳樓自殺。
影片最後浮現出的是阿叔的笑容，陰謀終於落幕，他成功地催眠了阿一，使他為自己賣命，而他最恨的垣原也在眼前死去。阿叔的笑容詭秘而陰冷，他最終也吊死在公園裡，這個圈套不知是誰為誰而設。
畫外音
在導演三池崇史眾多的影片中，《殺手阿一》是一部極度顛覆的作品，它表現了一個卡通化而非現實的都市，充滿了末世寓言的意味。金屬鏈條摩擦帶來的飛速感，人物的瞬間定格，粗顆粒的仿DV片段，讓人毛髮直豎的臺詞，當然還有那張讓你永遠記住的血盆大口。如果要用一個字形容這部影片，那就是——酷。在三池崇史所構建的異色都市中，戀父殺母的孩子、雌雄同體的女中學生、兒童殺手、雙重人格的怪胎，紛紛成為你方唱罷我登場的主角。無保留的“非人性”暴力已經成為了他的慣用佐料。
第3場 極致的變態/盛開的邪惡（5）
暴力發生的原因是什麼？這個問題的意義只存在於反思暴力渴望和平的電影中，而在三池崇史的影片裡，你休想找到答案。垣原對於暴力的迷戀更多的應該是習慣，暴力的生活已經成為他正常的生活，不亞於餓了吃飯困了睡覺，他迷戀於施虐與受虐，兩者都能給他帶來極度的快感。
他對安生的迷戀就是對暴力的迷戀，他渴望暴力帶給自己迷幻藥般的極致感覺。而阿一，這個有著孩子眼睛的冷血殺手，他所製造的暴力，直接與噴濺的鮮血、破碎的器官、各種令人毛骨悚然的景象共生。暴力對於他來說，是解脫，是宣洩，也是更深的迷惘。
在電影中，暴力更像一種潛規則，如果你身在其中，便無法逃脫，只能享受。三池崇史突出和渲染了影片中的血腥和暴力。
殺手阿一不斷地用飛快的利刃切割人的身體，使他們同豬狗無異，但如此瘋狂的殺戮卻有著崇高的目的：懲罰所有欺負好人的壞人，做正義的使者！每次殺人以後，恐懼與負罪使他無比矛盾。
阿一的暴力始於一次青少年時的噩夢，當他飽受高中同學欺凌時，一個女孩去救他，卻慘遭強Jian。他的膽怯使他不敢挪動一步，而更為恥辱的是，強Jian的場面刺激了他的性慾，他並不想救她，而是想侵犯她。這成為阿一癲狂的根源，在白天，他像一隻懦弱的羔羊；晚上，他所向披靡，殺人如麻。他本性也許是善良的，但他的思維方式已經極度扭曲，當被強Jian的女孩玩笑式地告訴他自己想嘗試被凌遲而達到高潮的快感，阿一居然不