日本人提供充足的食物。
事實上，到2037年，日本已經成為海洋漁業淨輸出國。
雖然日本輸出的水產品，多半隻為了換取小麥、稻米、玉米、土豆等等農作物，其基本食物產量仍然只能滿足自需，但是數百萬日本人的濫捕行為嚴重破壞了海洋生態，與綠色和平組織等國際機構多次爆發衝突。
從某種意義上講，2033年在聯合國獲得透過的《國際海洋生態法》中，取柿了“科學捕鯨”，就是針對日本人的濫捕行為，保護稀有程度比日本人還要高得多的藍鯨、長鬚鯨等珍貴鯨類。
幫助日本難民解決吃飯問題的同時，美國當局也在積極幫助日本人進行本土清理工作。
2033年，第一支清理當隊伍登上了日本本土，清理工作正式開始。
雖然在處理戰爭難民的遺骸時，清理隊員遇到了很多問題，在第一批登陸日本的清理隊伍中，近三分之一的隊員精神崩潰。但是這是現實的，而不是在拍電影，也就沒有那些只有在電影中才會出現的怪物。
事實上，放射性汙染造成的影響遠沒有電影與小說中說得那麼恐怖。
造成汙染的主要是爆炸產生的放射性塵埃，而這些肉眼幾乎見不到的塵埃會隨著降水回到地面，然後滲透到地下，最終離開地表。因為日本地處北溫帶，常年受黑潮影響，氣溫比同緯度地區偏高，降雨比較充沛，所以大約2到3年，放射性汙染就會降低到不足以致命的地步，3到5年就能回到正常水平。也就是說，這比之前某些科學家提出的，日本需要20年才能恢復元氣的預測短得多。
第一支清理隊伍的主要工作就是確定是否可以進行戰後重建工作。
結論是，除了核設施廢墟附近的放射性汙染仍然嚴重超標之外，其他地區的汙染已經降到正常水平。因為最後一批留在島上的日本人在2030年年底之前就完蛋了，島上倖存下來的動物與植物獲得了更大的發展空間，所以在清理隊員上岸的時候，日本幾乎是一個森林覆蓋率接近百分之百的國家。
因為關東平原的地理條件最好，而且受河流眾多影響，環境也最好，所以清理工作首先在關東平原展開。
當年年底，美國就為日本提供了第一批戰略援助物資與重建裝置。
也就在這個時候，日本當局提出了第一個“五年計劃”。按照日本人的規劃，在第一個五年之內，不但要將關東地區建成能夠滿足所有日本人生活需求的糧倉，還要把東京建成一個人口超過100萬的大城市。
如同第二次世界大戰後一樣，日本人再次開始了重建工作。
與二戰後的重建不同的是，因為嚴重汙染區域分佈得太廣，而且非嚴重汙染區域也不適合人類長期居住，所以重建工作首先以清理廢墟開始，而且重建所需的原材料，包括水泥這些最基本的原材料，都得從國外進口，能夠在日本找到的，恐怕就只有淡水了，而且還得是那幾條汙染最輕的河流中淡水。正是如此，重建工作開始後，日本當局沒有立即向本土移民，而是以輪換工作的方式，派遣建設人員返回本土展開重建工程。似乎是自我解嘲，日本當局宣稱這麼做，能夠像在一張白紙上作畫一樣，把新日本建設成世界上最美麗、最文明與最漂亮的國家。
非常不幸的是，日本人的好日子只過了1年半。
隨著印度戰爭爆發，日本重建物資的主要產地遭到滅頂之災，物資供應遠遠跟不上重建需求，重建工作被迫放緩。雖然日本當局有所預見，知道印度遲早會倒黴，在進行重建的時候，將距離本土很近的新島規劃為日本的第一個工業區，而且是第一個以生產重建物資為主的工業區，並且在印度戰爭爆發前完成了基礎建設，但是僅僅一個工業區，根本不可能生產出足夠全部重建工作所需的物資，而美國的勞動力成本太高，不可能幫助日本生產如同水泥、鋼鐵這些初級工業產品。
受印度戰爭影響，直到2040年中期，日本第一個五年計劃的目標才基本實現。
2040年底，日本開始有計劃的向國內移民。準確的說，是向“新東京市”移民。因為美國當局在“新東京市”的建設上給予了最大的幫助，所以日本當局準備在2042年7月1日舉行的城市命名典禮上，將“新東京市”命名為“美日市”，以此象徵美國與日本的深厚傳統友誼。
不管怎麼說，在10多年前被打垮的日本正在站起來。
雖然按照最樂觀的估計，到2065年之前，日本都很難威脅到共和國，畢竟人口的恢復遠沒有城市